自己レスです！
多層構造の簡単なテストをするため、
000.htm 001.htm 002.htm という３ファイルを作りました。
Ｄディスク下にフォルダ test を作って、この中に、 000.htm を入れます。
フォルダ test の中に、フォルダ aaa を作って、この中に、 001.htm を入れます。
フォルダ aaa の中に、フォルダ bbb を作って、この中に、 002.htm を入れます。
各ファイルには、下のようなローカルリンクを書いて、三者間でリンクを張りました。
<A HREF="file:///D:/test/000.htm">０００</A>
<A HREF="file:///D:/test/aaa/001.htm">００１</A>
<A HREF="file:///D:/test/aaa/bbb/002.htm">００２</A>
以上の、条件でやってみたところ、
Internet Explorer 3.02 でも、ローカルリンクを跳びました。全く問題ありませんでした。
つまり、フォルダ名が日本語の場合だと、跳ばない、という理由のようでした。
☆ 私の場合はすでに、２００ファイル近くあって（以前からファイル名は半角英数字）、この中のローカルリンク記載にある日本語のフォルダ名は、数千個以上でしょうから、今さら改変する気は起こりませんが、
Internet Explorer 3.02 をお持ちの方で、（発言＃１３１９のように）ファクトリーでアップする場合、フォルダ名も半角英数字で書いていけば、ローカルリンクの方もちゃんと跳べる（ローカルでの検証ができる）ということになります。
☆ どうも、思い込みによる、不正確な発言をして、申し訳ありませんでした。
ｍ （ _ _ ） ｍ
☆ ただし、まだ、上のような簡単なテストの結果だけによる解釈です。これもまた、新しい「思い込み」かもしれません。どうぞ、誤りがあったら指摘してください。